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【生信简单文章复现】差异分析+WGCNA+功能富集分析+PPI网络+Hub基因验证

目录WGCNA简介两个假设一般步骤 数据准备差异分析参数解释Limma包差异分析 WGCNA分析构建基因共表达网络模块与临床特征的相关性分析GO富集分析KEGG富集分析PPI分析验证关键基因  写在最后​​​​​​​WGCNA简介WeightedGeneCo-ExpressionNetworkAnalysis,加权基因共表达网络,将复杂生物过程的基因共表达网络划分为高度相关的几个特征模块,其代表着机组高度协同变化的基因集,并可将模块与待定的临床特征建立关联,在研究表型性状与基因关联分析等方面的研究中被广泛应用。两个假设相似表达模式的基因可能存在共调控、功能相关或处于同一通路基因网络符合无标度分

c++ - 访问硬编码数组和运行时初始化数组之间是否存在任何性能差异?

例如,我想使用数组SQRT[i]创建一个平方根表来优化游戏,但我不知道在访问SQRT[i]的值时,以下初始化之间是否存在性能差异:硬编码数组intSQRT[]={0,1,1,1,2,2,2,2,2,3,3,.......255,255,255}在运行时产生值(value)intSQRT[65536];intmain(){for(inti=0;i访问它们的一些例子:if(SQRT[a*a+b*b]>something)...我不清楚程序是否以不同的方式存储或访问硬编码数组,也不知道编译器是否会优化硬编码数组以加快访问时间,是否有性能它们在访问数组时的区别? 最

c++ - RAND_MAX 和 UINT_MAX 之间的差异会有所不同吗?

我的作业涉及生成0和2^30之间的随机整数。现在,在过去我们了解到rand()只返回小于RAND_MAX的整数,这小于UINT_MAX,并且我们可以使用位移来填充UINT_MAX容量。从我所做的一些阅读中(这里,关于SO),我意识到如果这些数字的分布对我很重要,这可能不是一个好主意。话虽如此,我的教授已经指定了这种方法。我的问题是,位移多少?RAND_MAX和UINT_MAX之间的差异是否始终存在一个安全常数来进行位移?或者是否需要进行一些初始探测以确定要移位的数字?我是否应该保持位移一点点并检查UINT_MAX?我问的原因是,UINT_MAX被定义为至少是某个数字(65535),但在

c++ - GCC 和 MSVC 之间的 digits10 差异

我有以下代码:#include#includeintmain(){std::cout::digits10GCC4.4返回19MSVS9.0返回18有人可以解释一下为什么两者之间有区别吗?无论编译器如何,我都希望这样的常量是相同的。 最佳答案 如果VisualC++2008返回18对于std::numeric_limits::digits10,这是一个错误(我没有安装VisualC++2008来验证所描述的行为)。在VisualC++中(至少对于32位和64位Windows),unsignedlonglong是64位无符号整数类型,能

c++ - 交换两个序列的元素,使得元素和的差异最小。

一道面试题:Giventwonon-orderedintegersequencesaandb,theirsizeisn,allnumbersarerandomlychosen:Exchangetheelementsofaandb,suchthatthesumoftheelementsofaminusthesumoftheelementsofbisminimal.举个例子:a=[513]b=[249]结果是(1+2+3)-(4+5+9)=-12。我的算法:将它们排序在一起,然后将第一个最小的n整数放在a中,剩下的放在b中。它在时间上是O(nlgn),在空间上是O(n)。我不知道如何将其改

串行事件值和串行端口值之间的差异

我正在使用JSSC来读取串行端口的值。一开始,我将以下回调写入串行端口。在该回调中,我可以从事件和串行端口本身中获取值都包含不同的值。我想知道串行端口值和串行事件值之间的差异是否包含来自串行端口的值?publicclassPortReaderimplementsSerialPortEventListener{SerialPortserialPort;publicPortReader(SerialPortserialPort){this.serialPort=serialPort;}@OverridepublicvoidserialEvent(SerialPortEventevent){Syst

C++如何警告函数声明和定义中参数名称之间的差异

有没有办法在函数声明与其定义之间的参数名称不匹配时收到警告?声明doubledivide(inta,intb);定义doubledivide(intb,inta){returna/b;}对于使用函数divide的用户,期望结果是a/b而不是b/a。我知道,编译器做不到,但是有一些静态分析工具可以做到吗?如果有,是哪些? 最佳答案 您可以使用clang-tidy。称它为编译器有点牵强,但也许有一个选项可以让clang发出clang-tidy警告。您想要的特定选项是readability-inconsistent-declaration

浅谈 Angular 和 UI5 这两种前端框架里控件 ID 的设计思路差异

最近笔者在工作中,修复了一些我团队负责的Angular应用里关于控件id的issue,正好我在从事Angular开发之前,使用UI5这个前端开发框架也工作了很多年。虽然二者都是优秀的企业级前端应用的开发框架,但二者无论是从设计理念还是开发思路上来说都有着很大的差异。所谓『管中窥豹,可见一斑』。本文从UI控件元素ID的生成逻辑这个切入点出发,向大家分享我对这两个前端框架设计理念差异的一些理解。我们先用UI5创建一个简单的button控件:UI5控件拥有对应的渲染器,比如Button的渲染器叫做ButtonRenderer,负责渲染出如下图高亮的HTML代码,其中控件ID为__button0.对于

c++ - 两条相似线路的 CPU 时间差异

我的程序中有一个while循环,其中IterZNext、IterZ是指向列表中节点的指针。列表中的节点是具有名为“索引”的字段的结构类型。doublexx=20.0;doubleyy=10000.0;doublezz;while(IterZNext!=NULL&&NextIndexNext;if(IterZNext!=NULL){zz=xx+yy;NextIndex1=IterZNext->Index;//line(*)NextIndex=IterZNext->Index;//line(**)IterZNext->Index;}}当我分析我的程序时,我发现了行(*)NextIndex1

c++ - C 和 C++ 的数组大小声明差异

constintnum=16;structinputs{doubleX1[num];doubleX2[num];};给我一​​个错误:error:variablymodified‘X1’atfilescope“X2”也是如此。不过我记得上面的C++没问题,上面的没问题(我可能会误认为是C++)。谁能帮我解释一下? 最佳答案 我可以给你指点CFAQ:Idon'tunderstandwhyIcan'tuseconstvaluesininitializersandarraydimensions.它基本上说的是num不是真正的常量,它只是只